上海交通大学经济学院与境内外数十所大学建立了广泛的联系，在师资培养、学生交流、科研合作及学术活动等方面保持了良好的合作关系。已合作的院校有：美国哈佛大学、美国亚利桑那州立大学、美国MIT斯隆管理学院、美国康奈尔大学、美国普林斯顿大学、美国南加州大学；加拿大不列颠哥伦比亚大学；香港中文大学、香港科技大学、香港城市大学等。

进入二十一世纪，上海交通大学经济学院秉承交大百年办学的优良传统，以进取、务实的态度，适时地调整办学理念，引进国外先进的办学模式和优质资源，开展国际化教育。